La programmazione dei Fondi Europei si divide in due categorie:
FONDI A GESTIONE DIRETTA: I programmi di sviluppo sono gestiti e monitorati direttamente dall'Unione Europea tramite le Direzioni Generali e le "Executive Agencies".
Per l'accesso ai fondi a gestione diretta: il beneficiario si relaziona direttamente con l’istituzione europea.
Esempi di fondi a gestione diretta sono: Erasmus plus – Creative Europe – Horizon2020
FONDI A GESTIONE INDIRETTA: Le risorse europee sono programmate dagli Stati e dalle Regioni.
Fondi a gestione indiretta: il beneficiario si relaziona con un ente preposto alla gestione del fondo (regioni, enti locali, ministeri agenzie nazionali etc..)
Esempi di fondi a gestione indiretta: POR Fse